Старший биоинформатик - анализ данных РНК-секвенирования

Описание

Отдел системной биологии и биоинформатики ищет опытных биоинформатиков для работы с данными транскриптомного секвенирования человека. Мы занимаемся формированием внутренних стандартов и best practices биоинформатической обработки данных, а также сопровождением биомедицинских исследований нацеленных на разработку новых способов лечения онкологических заболеваний. Планируется работа с различными данными: транскриптомы условно здоровых людей, данные образцов в парах опухоль-норма .

Стек технологий:

• Язык разработки: Python, bash
• Работа с пайплайнами: Docker, CWL
• Совместная работа над кодом: GitLab

Обязанности:

• Поддержание и развитие существующих пайплайнов по анализу данных RNA-Seq.
• Разработка новых пайплайнов для обработки данных RNA-seq человека (образцы крови, тканей, солидных опухолей).
• Формирование и проверка научных гипотез, биологическая интерпретация результатов.
• Планирование и контроль проведения экспериментов в лаборатории.
• Участие в создании и поддержке внутренних баз данных.
• Разработка и ведение технической документации, методических документов.
• Написание научных публикаций, представление на конференциях результатов исследований.

Требования:

• Опыт работы с онкологическими данными, опыт клинического анализа данных секвенирования.
• Понимание принципов таргетной и персонализированной онкотерапии.
• Навыки самостоятельной работы; готовность брать на себя ответственность за результат.
• Готовность заниматься методической работой, написанием технической документации.
• Внимательность, аккуратность.
• Наличие опыта работы в лаборатории (выделение ДНК/РНК, подготовка библиотек для секвенирования, валидация результатов транскриптомного анализа молекулярными методами) будет плюсом.

Организационные требования:

• Наличие диплома о высшем образовании. В приоритете техническое, математическое, биоинформатическое, медико-биологическое образование.
• Минимум 7 лет стажа работы по специальности или наличие кандидатской степени.
• Очное присутствие в офисе в Москве обязательно.

Будет плюсом:

• Понимание принципов работы технологий высокопроизводительного секвенирования.
• Наличие открытых репозиториев на Github.
• Умение работать с вычислительными кластерами.
• Инициативность.

Условия:

• Конкурентная заработная плата, обсуждается индивидуально в зависимости от опыта работы.

• Офисный формат работы, полная занятость, пятидневный график работы с гибким началом дня.

• Стабильная организация, которой не страшен кризис.
• Прикрепление к ведомственной поликлинике ФМБА.
• Выход на работу не ранее первого квартала 2026 года.