Руководитель группы биоинформатики
Описание
Обязанности: Руководство отделом биоинформатики, планирование загрузки и приоритизация, постановка и декомпозиция задач, контроль сроков и качества; Наставничество и развитие сотрудников (junior-middle), регулярная обратная связь; код-ревью как инструмент развития и поддержания стандартов разработки; Участие в подборе, оценке и адаптации сотрудников группы; Продуктовая разработка биоинформатических решений в составе медизделий (IVD): проектирование, разработка и оптимизация пайплайнов анализа NGS-данных (определение и аннотация вариантов, CNV/BAF и др.) и внутренних инструментов; Доведение пайплайнов до промышленного качества (production-grade); определение границы валидируемого пайплайна и прослеживаемость «требование - реализация - тест»; Аналитическая валидация и верификация пайплайнов: планирование и проведение, оценка характеристик (правильность, прецизионность, предел обнаружения, чувствительность/специфичность, робастность), формирование приёмочных критериев; Управление рисками ПО и контроль изменений для зарегистрированных изделий: заморозка валидированных версий пайплайнов и референсных баз/аннотаций; Подготовка и поддержание в актуальном состоянии проектной, технической, пользовательской и валидационной документации, в том числе для регистрационного досье (Росздравнадзор); Биоинформатический и статистический анализ результатов лабораторных, верификационных и валидационных исследований; корректная интерпретация и обоснованные выводы; Клиническая интерпретация результатов и работа с профильными базами знаний; Взаимодействие с лабораторией, разработкой ПО, регистрацией/СМК и управлением проектами; участие в формировании дорожной карты и технологическом развитии группы. Требования: Языки: Python, R. Инструменты: Snakemake, Docker, Git; Linux/CLI; Инженерные практики: CI/CD, контейнеризация, автоматизированное тестирование, воспроизводимость вычислений; облачные платформы (Yandex Cloud) - сильный плюс; Понимание жизненного цикла разработки ПО медицинского назначения (аналог ГОСТ Р ИЭК 62304) и работы в рамках СМК (ISO 13485) - сильный плюс; Реальный опыт линейного руководства командой разработки: постановка/декомпозиция задач, код-ревью, развитие сотрудников (не только роль техлида); Специализация: геномная биоинформатика, разработка пайплайнов, определение и аннотация вариантов (SNV/индел, CNV/BAF и др.); Аналитическая валидация и верификация диагностических пайплайнов: характеристики метода и приёмочные критерии; управление рисками ПО и контроль изменений; Клиническая интерпретация результатов и работа с профильными базами знаний; Опыт написания технической, пользовательской и валидационной документации. Условия: График работы 5/2 с 9:00 до 18:00; Работа в комфортном бизнес-центре; Компенсация изучения английского языка; Крутая и профессиональная команда, где мнение каждого важно и ценно; Оформление согласно ТК РФ, все социальные гарантии; Компания является резидентом Инновационного центра Сколково, головной офис в Москве; Адрес работы: Санкт-Петербург, 18-я линия Васильевского острова, 29Б, м. Василеостровская, БЦ Сенатор.